MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331 chromosome

Total Repeats: 56359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013124	CGG	2	6	37156	37161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370860
1002	NC_013124	TCG	2	6	37215	37220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1003	NC_013124	GCTGG	2	10	37234	37243	0 %	20 %	60 %	20 %	256370860
1004	NC_013124	CG	3	6	37246	37251	0 %	0 %	50 %	50 %	256370860
1005	NC_013124	GTGG	2	8	37346	37353	0 %	25 %	75 %	0 %	256370860
1006	NC_013124	GCG	2	6	37373	37378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370860
1007	NC_013124	TCG	2	6	37386	37391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1008	NC_013124	CGT	2	6	37399	37404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1009	NC_013124	CTG	2	6	37457	37462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1010	NC_013124	GC	3	6	37470	37475	0 %	0 %	50 %	50 %	256370860
1011	NC_013124	GCG	2	6	37491	37496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370860
1012	NC_013124	GC	3	6	37500	37505	0 %	0 %	50 %	50 %	256370860
1013	NC_013124	TCG	2	6	37540	37545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1014	NC_013124	TCG	2	6	37554	37559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1015	NC_013124	TCGCGG	2	12	37608	37619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	256370860
1016	NC_013124	GC	3	6	37703	37708	0 %	0 %	50 %	50 %	256370860
1017	NC_013124	GGC	2	6	37739	37744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370860
1018	NC_013124	CTC	2	6	37772	37777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370860
1019	NC_013124	ATC	2	6	37802	37807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370860
1020	NC_013124	CTC	2	6	37817	37822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370860
1021	NC_013124	AGG	2	6	37894	37899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370860
1022	NC_013124	CGG	2	6	37917	37922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370860
1023	NC_013124	TCG	2	6	37941	37946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1024	NC_013124	CGT	2	6	37951	37956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1025	NC_013124	CTG	2	6	37964	37969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370860
1026	NC_013124	CGGTG	2	10	38002	38011	0 %	20 %	60 %	20 %	256370860
1027	NC_013124	CGG	2	6	38016	38021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370860
1028	NC_013124	ATC	3	9	38030	38038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370860
1029	NC_013124	CCG	2	6	38059	38064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370860
1030	NC_013124	GTG	2	6	38083	38088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370860
1031	NC_013124	CGC	2	6	38117	38122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370861
1032	NC_013124	CTC	2	6	38130	38135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370861
1033	NC_013124	CG	3	6	38139	38144	0 %	0 %	50 %	50 %	256370861
1034	NC_013124	TCG	2	6	38155	38160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370861
1035	NC_013124	GCG	2	6	38171	38176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370861
1036	NC_013124	CCG	2	6	38215	38220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370861
1037	NC_013124	GAT	2	6	38262	38267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370861
1038	NC_013124	TCT	2	6	38471	38476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256370861
1039	NC_013124	GCC	2	6	38523	38528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370861
1040	NC_013124	GTC	2	6	38628	38633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370861
1041	NC_013124	GAT	2	6	38637	38642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370861
1042	NC_013124	CGA	2	6	38789	38794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370861
1043	NC_013124	CGC	2	6	38823	38828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370861
1044	NC_013124	CGGG	2	8	38837	38844	0 %	0 %	75 %	25 %	256370861
1045	NC_013124	GAC	2	6	38859	38864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370861
1046	NC_013124	GTA	2	6	38871	38876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370861
1047	NC_013124	GTT	2	6	38952	38957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256370861
1048	NC_013124	TCG	3	9	39001	39009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370861
1049	NC_013124	GGC	2	6	39018	39023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370861
1050	NC_013124	GAC	2	6	39024	39029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370861
1051	NC_013124	GTC	2	6	39090	39095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370861
1052	NC_013124	GTA	2	6	39108	39113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370861
1053	NC_013124	CGT	2	6	39236	39241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013124	GAC	2	6	39253	39258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_013124	GTC	2	6	39276	39281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1056	NC_013124	AGCC	2	8	39292	39299	25 %	0 %	25 %	50 %	256370862
1057	NC_013124	GCG	2	6	39303	39308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370862
1058	NC_013124	CGTG	2	8	39332	39339	0 %	25 %	50 %	25 %	256370862
1059	NC_013124	CTC	2	6	39392	39397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370862
1060	NC_013124	CGA	2	6	39406	39411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1061	NC_013124	CGA	2	6	39420	39425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1062	NC_013124	GCA	2	6	39430	39435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1063	NC_013124	GCGCG	2	10	39438	39447	0 %	0 %	60 %	40 %	256370862
1064	NC_013124	CCA	2	6	39472	39477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370862
1065	NC_013124	TCG	2	6	39498	39503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1066	NC_013124	GC	3	6	39536	39541	0 %	0 %	50 %	50 %	256370862
1067	NC_013124	TCG	2	6	39549	39554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1068	NC_013124	CACCG	2	10	39656	39665	20 %	0 %	20 %	60 %	256370862
1069	NC_013124	GC	3	6	39686	39691	0 %	0 %	50 %	50 %	256370862
1070	NC_013124	AGCG	3	12	39694	39705	25 %	0 %	50 %	25 %	256370862
1071	NC_013124	GCC	2	6	39792	39797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370862
1072	NC_013124	ACG	2	6	39804	39809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370862
1073	NC_013124	CCG	2	6	39826	39831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370862
1074	NC_013124	CG	3	6	39842	39847	0 %	0 %	50 %	50 %	256370862
1075	NC_013124	TCGAT	2	10	39893	39902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1076	NC_013124	CGT	2	6	39956	39961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370863
1077	NC_013124	CG	5	10	39972	39981	0 %	0 %	50 %	50 %	256370863
1078	NC_013124	GGT	2	6	39987	39992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370863
1079	NC_013124	CCA	2	6	40000	40005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370863
1080	NC_013124	GC	3	6	40040	40045	0 %	0 %	50 %	50 %	256370863
1081	NC_013124	AGA	2	6	40070	40075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256370863
1082	NC_013124	GT	3	6	40077	40082	0 %	50 %	50 %	0 %	256370863
1083	NC_013124	GCG	2	6	40107	40112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370863
1084	NC_013124	GT	3	6	40140	40145	0 %	50 %	50 %	0 %	256370863
1085	NC_013124	TG	4	8	40148	40155	0 %	50 %	50 %	0 %	256370863
1086	NC_013124	TGCGT	2	10	40163	40172	0 %	40 %	40 %	20 %	256370863
1087	NC_013124	GTC	2	6	40218	40223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370863
1088	NC_013124	TCG	2	6	40234	40239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370863
1089	NC_013124	AGG	2	6	40240	40245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370863
1090	NC_013124	GTCT	2	8	40287	40294	0 %	50 %	25 %	25 %	256370863
1091	NC_013124	GAG	2	6	40396	40401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013124	ACG	2	6	40529	40534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1093	NC_013124	GC	3	6	40543	40548	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1094	NC_013124	CGA	2	6	40554	40559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1095	NC_013124	TCG	2	6	40580	40585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1096	NC_013124	CAC	2	6	40654	40659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370864
1097	NC_013124	GCG	2	6	40663	40668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370864
1098	NC_013124	GCG	2	6	40671	40676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370864
1099	NC_013124	TCG	3	9	40694	40702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1100	NC_013124	ACC	2	6	40724	40729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370864
1101	NC_013124	GCC	2	6	40753	40758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370864
1102	NC_013124	GC	3	6	40770	40775	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1103	NC_013124	GC	3	6	40778	40783	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1104	NC_013124	G	6	6	40800	40805	0 %	0 %	100 %	0 %	256370864
1105	NC_013124	GC	4	8	40839	40846	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1106	NC_013124	C	6	6	40877	40882	0 %	0 %	0 %	100 %	256370864
1107	NC_013124	GTC	2	6	40909	40914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1108	NC_013124	TCG	2	6	40928	40933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1109	NC_013124	ATCGGT	2	12	41056	41067	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256370864
1110	NC_013124	CGC	2	6	41190	41195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370864
1111	NC_013124	CGAG	2	8	41291	41298	25 %	0 %	50 %	25 %	256370864
1112	NC_013124	CGT	2	6	41302	41307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370864
1113	NC_013124	GC	3	6	41312	41317	0 %	0 %	50 %	50 %	256370864
1114	NC_013124	CGA	2	6	41414	41419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1115	NC_013124	CGC	2	6	41432	41437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370865
1116	NC_013124	GGT	2	6	41442	41447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370865
1117	NC_013124	GGT	2	6	41453	41458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370865
1118	NC_013124	GA	3	6	41505	41510	50 %	0 %	50 %	0 %	256370865
1119	NC_013124	CGA	2	6	41534	41539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1120	NC_013124	TCG	2	6	41590	41595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1121	NC_013124	CGA	2	6	41603	41608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1122	NC_013124	GTC	2	6	41611	41616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1123	NC_013124	AGG	2	6	41635	41640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370865
1124	NC_013124	CGA	2	6	41688	41693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1125	NC_013124	CG	3	6	41718	41723	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1126	NC_013124	ACG	2	6	41779	41784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1127	NC_013124	CGA	2	6	41956	41961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1128	NC_013124	GAT	2	6	42003	42008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370865
1129	NC_013124	AGC	2	6	42031	42036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1130	NC_013124	TCA	2	6	42098	42103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256370865
1131	NC_013124	GAC	2	6	42120	42125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1132	NC_013124	CGC	2	6	42154	42159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370865
1133	NC_013124	GC	4	8	42158	42165	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1134	NC_013124	GTC	2	6	42195	42200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
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1137	NC_013124	CGGAG	2	10	42278	42287	20 %	0 %	60 %	20 %	256370865
1138	NC_013124	CG	3	6	42302	42307	0 %	0 %	50 %	50 %	256370865
1139	NC_013124	GCGAC	2	10	42311	42320	20 %	0 %	40 %	40 %	256370865
1140	NC_013124	CGAG	2	8	42353	42360	25 %	0 %	50 %	25 %	256370865
1141	NC_013124	CAG	2	6	42363	42368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
1142	NC_013124	GCTC	2	8	42374	42381	0 %	25 %	25 %	50 %	256370865
1143	NC_013124	CGA	2	6	42449	42454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
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1146	NC_013124	AGC	2	6	42484	42489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
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1156	NC_013124	TCG	2	6	42859	42864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370865
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1158	NC_013124	CGA	2	6	42962	42967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370865
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1166	NC_013124	CGG	2	6	43260	43265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370866
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1181	NC_013124	CGGA	2	8	43686	43693	25 %	0 %	50 %	25 %	256370867
1182	NC_013124	GCA	2	6	43703	43708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370867
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1207	NC_013124	CGGTG	2	10	44600	44609	0 %	20 %	60 %	20 %	256370869
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1211	NC_013124	TCC	2	6	44775	44780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1212	NC_013124	ATG	2	6	44806	44811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1213	NC_013124	CGG	2	6	44879	44884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370870
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1231	NC_013124	CGA	2	6	45409	45414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370870
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1235	NC_013124	TCG	2	6	45512	45517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1236	NC_013124	CCCGC	2	10	45559	45568	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1237	NC_013124	CTC	2	6	45630	45635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1238	NC_013124	GGT	2	6	45641	45646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1239	NC_013124	GTG	2	6	45648	45653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370871
1240	NC_013124	GCC	2	6	45666	45671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370871
1241	NC_013124	GTC	2	6	45699	45704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370871
1242	NC_013124	GT	3	6	45766	45771	0 %	50 %	50 %	0 %	256370871
1243	NC_013124	CTG	2	6	45798	45803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370871
1244	NC_013124	GTC	3	9	45819	45827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370871
1245	NC_013124	GTG	2	6	45862	45867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370871
1246	NC_013124	CGC	2	6	45917	45922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370871
1247	NC_013124	CGA	2	6	45940	45945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370871
1248	NC_013124	GC	3	6	45946	45951	0 %	0 %	50 %	50 %	256370871
1249	NC_013124	GCT	2	6	45992	45997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370871
1250	NC_013124	GAAC	2	8	46028	46035	50 %	0 %	25 %	25 %	256370871
1251	NC_013124	GAT	2	6	46069	46074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370872
1252	NC_013124	CCGGT	2	10	46125	46134	0 %	20 %	40 %	40 %	256370872
1253	NC_013124	CG	3	6	46148	46153	0 %	0 %	50 %	50 %	256370872
1254	NC_013124	CCG	2	6	46242	46247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370872
1255	NC_013124	CCT	2	6	46276	46281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256370872
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1258	NC_013124	TCG	3	9	46443	46451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370872
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1271	NC_013124	CGC	2	6	46868	46873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256370873
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1275	NC_013124	CGG	2	6	47072	47077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370873
1276	NC_013124	GGA	2	6	47096	47101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370873
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1279	NC_013124	GTG	2	6	47183	47188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370873
1280	NC_013124	GGA	2	6	47207	47212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370873
1281	NC_013124	GAC	2	6	47223	47228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370873
1282	NC_013124	CGA	2	6	47231	47236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370873
1283	NC_013124	TGG	2	6	47252	47257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370873
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1287	NC_013124	GGA	2	6	47378	47383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370873
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1290	NC_013124	AGG	2	6	47491	47496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370873
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1292	NC_013124	ACG	2	6	47584	47589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370873
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1294	NC_013124	CGA	2	6	47654	47659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370873
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1297	NC_013124	CGA	2	6	47723	47728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370873
1298	NC_013124	AGCCT	2	10	47810	47819	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1299	NC_013124	GC	3	6	47853	47858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1300	NC_013124	GTG	2	6	47864	47869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256370874
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1313	NC_013124	GGC	2	6	48425	48430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370874
1314	NC_013124	ACCTCG	2	12	48509	48520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	256370874
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1317	NC_013124	CGA	2	6	48697	48702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370875
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1343	NC_013124	CG	3	6	49857	49862	0 %	0 %	50 %	50 %	256370875
1344	NC_013124	CGT	2	6	50059	50064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256370875
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1348	NC_013124	GAC	2	6	50213	50218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370875
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1352	NC_013124	GAG	2	6	50402	50407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256370875
1353	NC_013124	CGA	2	6	50428	50433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370875
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1355	NC_013124	GCTC	2	8	50459	50466	0 %	25 %	25 %	50 %	256370875
1356	NC_013124	CGG	2	6	50490	50495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256370875
1357	NC_013124	CAC	2	6	50510	50515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256370875
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1359	NC_013124	CCT	2	6	50584	50589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1368	NC_013124	CGA	2	6	51026	51031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370876
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1370	NC_013124	GCA	2	6	51055	51060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256370876
1371	NC_013124	AGT	2	6	51080	51085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256370876
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